第一临床医学院（附属四六五医院）

吉林医药学院附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的大型三级甲等综合性医院。医院是国家住院医师规范化培训基地，国家临床教学培训示范中心，吉林市区域医疗联合体核心医院。

第二临床医学院（附属梅河口市中心医院）

梅河口市中心医院位于吉林省梅河口市康美大道2688号，始建于1948年，是一所集医疗、科研、教学、康复、急救为一体的综合医院，是国家级爱婴医院，吉林医药学院第二附属医院。

第三临床医学院（附属松原吉林油田医院）

松原吉林油田医院始建于1961年，是一所集医疗、科研、教学、保健、康复、职业卫生和社区服务为一体的大型综合性三级甲等医院。是吉林医药学院第三临床医学院，北华大学临床医学硕士专业学位研究生专业实践基地，吉林大学第一医院医联体成员单位。

第四临床医学院（附属四平市中心人民医院）

四平市中心人民医院暨中国医科大学四平医院是一所现代化大型综合性三级甲等医院。始建于1978年。是吉林省全科医生临床培养基地、中国医科大学、延边大学、吉林医药学院等6所高等医学院校临床教学医院。

第五临床医学院（附属吉林市人民医院）

吉林市人民医院于2011年11月由原吉林市第二中心医院和吉林市医院整合组建而成，是一所已有110年历史沿革，集医疗、教学、科研、预防保健为一体的综合性三级甲等医院。医院坐落于吉林省吉林市昌邑区，交通便利，一直有着吉林市医疗门户之称。

第六临床医学院（附属通化市中心医院）

通化市中心医院始建于1949年,是通化地区唯一一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的综合性全民所有制三级甲等医院,吉林省东南部区域医疗中心，是国家胸痛中心、国家高级卒中中心、国家药物临床试验机构、长春医学高等专科学校和白城医学高等专科学校医教协同单位、延边大学医学院临床教学医院。

吉林省吉林市中西医结合医院

中西医结合医院，即吉林省吉林中西医结合医院。位于吉林市，医院是吉林省中西医结合医、教、研基地，是一所三级甲等中西医结合综合性医院。2003年12月被国家中医药管理局确定为国家级重点中西医结合医院建设单位。

舟山医院

舟山医院位于浙江省舟山市定海区，由原舟山市人民医院、市妇幼保健院和市中医骨伤联合医院于2009年5月12日组建而成，是一家综合性医院，为省级文明医院和省级示范文明医院。

上海市同仁医院

上海市同仁医院，又名上海交通大学医学院附属同仁医院、上海市同仁红十字医院，成立于1866年，是上海开埠以来最早的西医院之一。是一所三级乙等综合性医院。地处上海西部虹桥地区，由仙霞路院区、哈密路教学中心和虹桥国际医学研究院三部分组成。

长春市中心医院

长春市中心医院位于吉林省长春市，是集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的现代化综合性三级甲等医院，也是国家区域医疗中心项目首都医科大学附属北京安贞医院吉林医院的依托医院。先后荣获全国文明单位、全国百佳医院、全国卫生系统先进单位、全国模范职工之家、吉林省先进基层党组织、长春市先进基层党组织标兵等殊荣。是国家住院医师规范化培训基地、吉林省全科医生转岗培训基地。

吉林大学第一医院

吉林大学第一医院始建于1949年，是集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的大型综合三级甲等医院。医院前身为中国人民解放军第一军医大学附属医院，曾先后定名为长春医学院内科学院、吉林医科大学第一临床学院、白求恩医科大学第一临床学院，2000年白求恩医科大学与吉林大学合并，更名为吉林大学第一医院。